[生技新知] 最真實的表觀調控分析!? 全新的單細胞 Methylome 及 Transcriptome 同時分析技術



  不久前由英國與比利時的研究團隊發展出全新的單細胞表觀遺傳研究技術,可於同時間進行單細胞的 epigenome 和 transcriptome 分析,藉此來連結DNA甲基化和基因表現的關聯性,此技術帶來的效益或許能更加瞭解在一般狀況、老化或者疾病癌症時生物體中的多樣性調控機制。

  這全新的方法發佈於 Nature Methods,稱之為 scM&T-seq,研究人員利用磁珠方式將單細胞檢體做 mRNA 及 DNA 的分離,分離的 RNA 用來進行 RNA-seq,DNA 的部分則進行 bisulfite-seq,藉此同時獲得 transcriptome 及 epigenome 的數據並交叉分析比對。研究人員選用 61 個老鼠的胚胎幹細胞 (ESCs, embryonic stem cells) 於不同的細胞階段來定序分析驗證其效果,最後發現許多過去未認知的甲基化與多能性基因關聯調控。未來此方法或許也能應用於臨床,作為更準確的多面向生物資訊分析判斷應用。




scM&T-seq 流程示意圖
 (http://www.nature.com/nmeth/journal/v13/n3/images/nmeth.3728-SF1.jpg)



Source: 
1. Angermueller C et al.,Parallel single-cell sequencing links transcriptional and epigenetic heterogeneity. Nature Methods. Mar. 2016.
2. New Method Simultaneously Profiles Methylome and Transcriptome in the Same Single Cell. (http://www.whatisepigenetics.com/new-method-simultaneously-profiles-methylome-and-transcriptome-in-the-same-single-cell/)

頁面主圖 : http://www.whatisepigenetics.com/new-method-simultaneously-profiles-methylome-and-transcriptome-in-the-same-single-cell/




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