這全新的方法發佈於 Nature Methods,稱之為 scM&T-seq,研究人員利用磁珠方式將單細胞檢體做 mRNA 及 DNA 的分離,分離的 RNA 用來進行 RNA-seq,DNA 的部分則進行 bisulfite-seq,藉此同時獲得 transcriptome 及 epigenome 的數據並交叉分析比對。研究人員選用 61 個老鼠的胚胎幹細胞 (ESCs, embryonic stem cells) 於不同的細胞階段來定序分析驗證其效果,最後發現許多過去未認知的甲基化與多能性基因關聯調控。未來此方法或許也能應用於臨床,作為更準確的多面向生物資訊分析判斷應用。
scM&T-seq 流程示意圖
(http://www.nature.com/nmeth/journal/v13/n3/images/nmeth.3728-SF1.jpg)
(http://www.nature.com/nmeth/journal/v13/n3/images/nmeth.3728-SF1.jpg)
Source:
1. Angermueller C et al.,Parallel single-cell sequencing links transcriptional and epigenetic heterogeneity. Nature Methods. Mar. 2016.
2. New Method Simultaneously Profiles Methylome and Transcriptome in the Same Single Cell. (http://www.whatisepigenetics.com/new-method-simultaneously-profiles-methylome-and-transcriptome-in-the-same-single-cell/)
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